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穿刺在临床上是一种非常简单，常用的操作，由于穿刺针很细，又在CT下进行，所以对患者的创伤是很小的。对于一些疾病，可以通过穿刺，然后置管引流的方式治疗，比如病灶出现脓肿，梗阻性黄疸，囊肿等疾病都可以采用这种方式治疗，把积液或者积脓穿出来，在注射药物治疗，达到治病的目的，或者向体腔注入气体或造影剂做造影检查。

不同部位穿刺使用不同规格的穿刺针，以八光穿刺针为例，胸腔穿刺使用18G-21G；腰椎穿刺18G或21G规格；卵泡穿刺18G；羊水穿刺胎儿3-4个月使用21G。

腰椎穿刺用于诊断中枢神经系统疾病，通过收集脑脊液来完成，在历史上，进行气脑造影的过程中也采用腰椎穿刺，通过腰穿将CSF替换为空气或其他气体，便于在平片上增强大脑某些区域的外观。

穿刺时将穿刺针垂直刺入，缓慢进针，针尖斜面应平行与患者身体长轴，避免损伤硬脊膜纤维，减少腰穿后头痛，如果不能判断是否有脑脊液流出，可以反复拔出针芯查看，但每次推进时先将针芯插入，拔针时不用插入针芯，脑脊液流出后，接上测压管检测压力。